Странно человеку не раз предложили 100% решение его проблемы и он его отверг.
Поможет только гальваническая развязка.
например блок питания в этой теме
http://pccar.ru/showthread.php?t=10277
Все твои симптомы:
1-Ноут запитан от 12в от борт сети, все возможные комбинации подключения есть шум.
2-ноут от батарейки подключен только аудио кабель-наслаждение чистейшим звуком.
Это всё я проходил. Решений есть несколько но ты их отверг увы других нет.
Но я повторю их, хотя все они сводятся к гальванической развязке тем или иным боком.
1- нормальный авто-усилитель( а нормальные авто усилители имеют импульсный блок питания с гальванической развязкой)
2- Использовать для передачи звука оптику чтоб развязать ноут и усилитель.
3-Блок питания наподобие ссылке выше. и подключить на него ноут, монитор все усб потребители, чтоб всё было запитано через него и чтоб не было контактов с борт сетью. И после этого через рса к усилителю.