Сегодня тоже бился с глюками сцуко-usb. Симптомы очень похожи на твои.
Оттюнил хаб по твоему примеру (спасибо тебе и folv за идею), хотя у меня в плане напряжения питания все тоже было ок в моменты глюков, добил одну из петель по GND, вторую не добил, но вроде уже полегчало. Тестов, правда, пока полномасштабных не было, но надежда живет
По результатам просмотра картинок возник вопрос - на коммутационном блок у тебя 2 входа usb типа b - один на хаб, а второй куда? Там петли случайно не живет?
И еще вопрос как к человеку явно разбирающемуся в вопросе - у меня 2 девайса (хаб и сидюк) были запитаны от одного 5в блока питания, при этом включены отдельными проводами в материнку (12в были только от БП, а вот минус и от БП, и от материнки). В результате были проблемы - решил перетыканием сидюка в хаб, но хотел бы все-таки его напрямую воткнут в материнку. Есть ли какая-то возможность развязать это хозяйство по питанию без отдельного БП на каждый девайс?