Материни mini-ITX предназначаются в более мелкие корпуса, чем их полноразмерные аналоги и их тепловой режим должен быть лучше оптимизирован.
Да и как показывает практика слоты расширений полноразмерных плат не часто используются, прежде всего из за их ненадежности в при вибрации. А дополнительные слоты, помимо размера, пусть и не много, но дополнительная электроника, а значит, дополнительные электропотребление и тепло.
Я предпочел mini-itx на мобильном чипсете, как наиболее меня устраивающая платформа по функциональности, энергопотреблению и по надежности крепления карт расширения.
Одно время пришлось поздить и с десктопным вариантом, на m-ATX. При том же функционале система жрала ощутимо больше, и соответственно была значительно горячее...
P.S. Ну кто-то вообще отдал предпочтитение формфактору 3.5"
