Посмотрел твой код.
Есть одно замечание: все переменные, которые используешь в прерываниях (Flag_Recv, toggle, count) нужно объявлять 'volatile', возможно в этом проблема.
И мне, в свое время, чем-то не понравилась эта библиотека от seeedstudio, я использовал другую. В архиве приложил.
Есть еще программка для вычисления регистров скорости для mcp2515 -
MBTime, мне очень помогла.