Удалось запустить Sygic. Не обошлось без танцев с бубном. Итак:
1. Sygic собран для arm, поэтому в настройках нужно включить Enable native bridge.
2. нужен android-x86_64, в 32-битной версии не работает,
3. установщик native bridge, встроенный в android-x86, использует для загрузки библиотек устаревшие ссылки и не срабатывает, поэтому надо самостоятельно загрузить 32 и 64-битные библиотеки с сайта
https://github.com/Rprop/libhoudini и поместить их в /system/etc с именами houdini.sfs и houdini64.sfs соответственно.
Проверено на android-x86_64-6.0-r3.iso